Nel 2006, i tre Dipartimenti del Complesso di San Giovanni in Monte: Archeologia, Discipline Storiche e Paleografia e Medievistica hanno avviato un progetto pilota per la riorganizzazione integrata dei servizi comuni: il Complesso di San Giovanni in Monte.
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Il patrimonio librario della Biblioteca è stato ed è continuamente arricchito sia nei fondamentali settore delle fonti, delle opere di consultazione e delle pubblicazioni periodiche, sia in fondi bibliografici specializzati relativi ai diversi filoni di ricerca attivati dai docenti.